По мере продвижения Советских войск на Запад существенно увеличивался и объём работы трофейных органов, а так же расширялись их задачи. С 5 апреля 1942 года создаётся Трофейный комитет, председателем которого назначается К.Е. Ворошилов. В подчинении этого органа находится 6 отдельных фронтовых трофейных бригад численностью по 2500 человек в каждой с приданными им эвакуационными ротами Главного бронетанкового управления Красной Армии и 39 отдельных трофейных батальонов численностью по 500 человек в каждом, кроме того, 5 эвакуационных поездов с командами в 200 человек и приданными тяжёлыми тягачами и водолазным снаряжением для подъёма техники со дна водоёмов.

По мере освобождения от немецкой оккупации территории СССР трофейная служба решала не только задачи по сбору трофеев, но и занималась восстановлением и охраной предприятий, разминированием железнодорожных станций, дорог и полей, ремонтом сельскохозяйственного оборудования и снабжением мирного населения освобождённых районов продовольствием.

Существенный вклад трофейные органы внесли в спасение похищенных гитлеровскими войсками культурных ценностей. Так, во время боёв в Восточной Пруссии, были спасены от гибели музейные и архивные материалы, связанные с жизнью и деятельностью великого польского астронома Н. Коперника. Позже они были переданы польскому государству. Военнослужащие из состава трофейных подразделений приняли участие в поисках и спасении картин Дрезденской галереи.

По решению советского руководства Трофейный комитет выделил средства –
2 миллиона шиллингов на восстановление разрушенной Венской оперы, так же были предоставлены и завезены необходимые стройматериалы.